DNA甲基化检测--重亚硫酸盐的测序法（Bisulfite Genomic Sequence，BSP）
重亚硫酸盐的测序法是一种灵敏的能直接检测分析基因组DNA甲基化模式的方法。重亚硫酸盐处理后，用针对改变后的DNA序列设计特异性引物并进行聚合酶链式反应（PCR）。
利用转座酶研究染色质可接近性的高通量测序
ATAC-seq可以检测染色质开放区域，其原理是通过转座酶Tn5容易结合在开放染色质区域的特性，对Tn5酶捕获到的DNA序列进行测序和富集分析。
焦磷酸测序
焦磷酸测序技术服务基于QIAGEN公司PyroMark平台，能提供SNP基因分型、等位基因频率分析和甲基化检测等技术服务。具有定量准确、快速、多位点同时分析等特点，已成为DNA数据分析的金标准。
大片段测序（BAC)
BAC克隆等大片段DNA测序已在国内外全基因组测序和功能基因筛选中得到广泛应用，但因为涉及高质量的shotgun文库构建和大规模、高通量测序平台的建立，目前国内除参加过人类基因组计划的研究机构外，还鲜